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青海省动物学会前身是青海省动植物学会，于1963年筹备，1964年正式成立并召开了学术年会，选举产生了理事会，由王忠温任理事长。“文化大革命”期间活动停止。1979年4月3日经青海省科委批准，与植物学会分离，成立了青海省动物学会。1980年2月，青海省动物学会正式成立。2012年，在青海省科学技术协会、中国动物学会和中科院西北高原生物研究所的关心、指导和支持下，青海省动物学会恢复活动。恢复活动以来，学会积极组织主办、参与各项学术交流活动。
青海省动物学会业务主管单位是青海省科学技术协会，办事机构支撑单位是中国科学院西北高原生物研究所。现有会员200余人。按照社会组织管理办法，青海省动物学会于2019年1月进行换届选举。第七届现任理事长张同作研究员，秘书长曲家鹏研究员。
现有分支机构青海省动物学会鸟类学分会，主要开展青海省鸟类的观测、摄影、保护及科普工作，旨在为青海省内外观鸟爱好者提供交流平台，共同促进观鸟、鸟类摄影和保护工作同步发展。
自2019年学会恢复活动以来，青海省动物学会在青海省科协的领导下，与国际动物学会、中国动物学会、全国各省、市、自治区、直辖市动物学会开展了广泛的合作交流，先后组织举办了丰富多彩的国际国内会议，包括：第一届青海省动物生态与资源保护学术研讨会、第九届整合动物学学术研讨会、第六届全国动物生理生态学学术研讨会、第三届和第十届中国西部动物学学术研讨会、西北珍稀动物保护利用学术论坛等，并举办了“青藏高原鼠害防治高级研修班”“国家公园示范省建设的野生动物监测与管理”等培训班，并积极参与国际动物学会、中国动物学会等举办的各项学术交流活动。
青海省动物学会荣获青海省“先进学会”，理事长张同作荣获“优秀学会工作者”、“青海省首批首席科学传播专家”等称号。
青海省动物学会每年组织会员举办、参与国际、国内重要学术会议，并积极推荐学会代表评选“青海省最美科技工作者”“全国学雷锋志愿服务“四个100”先进典型”“优秀科技创新团队”等，邀请青海省委党校教授宣讲二十大精神等，努力为青海省动物学工作者和爱好者服务，成为科技工作者交流的优秀桥梁与平台。